[FREEZE/CRASH] Installation lib python [Résolu]

Questions et astuces concernant l'installation et la configuration d'archlinux
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x4rkz
Daikyu
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[FREEZE/CRASH] Installation lib python [Résolu]

Message par x4rkz »

Bonsoir,

J'ai installé Archlinux il y a quelques jours et tout fonctionne bien sauf quelques crash/freeze.

Lorsque j'essaie d'installer une bibliothèque python en utilisant pip install numpy (j'ai testé numpy et matplotlib), les fichiers se téléchargent et au lancement de python setyp.py install le système plante : aucune réponse clavier/souris, pas d'accès aux tty ... Si on effectue cette commande depuis un tty on a un message au bout de quelques temps qui dit que le système a planté et qu'il va redémarrer dans 30sec.

Voilà c'est génant car je n'arrive pas à installer de bibliothèque python, mais aussi parce que cela se produit pour d'autres raisons par exemple pendant un pacman -S texlive-most, et quelques fois (rare) sans aucune raison apparente. Ces freezes apparaissent donc de façon générale lors de l'installation d'un paquet (avec pacman ou pip).

Donc je fais appel à vous pour m'aider à installer des libs python, et également pour m'aider à cerner le problème en question.

Merci beaucoup !
Dernière modification par x4rkz le mer. 30 déc. 2015, 23:56, modifié 1 fois.
Moviuro
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par Moviuro »

Plop,

il faut nous dire si tu fais face à un "kernel panic" : si c'est le cas, la diode "Majuscules activées" de ton clavier clignote.

À mon avis ton disque est mort. Essaye d'installer smartmontools et lance les tests de disque: (https://wiki.archlinux.org/index.php/S. ... Run_a_test) (copie-colle le résultat ici si tu n'arrives pas à le comprendre)

Code : Tout sélectionner

# smartctl -t long /dev/<device>
# smartctl -a /dev/<device>
Regarde aussi l'état de ta RAM à l'aide d'un memtest.

Bon courage,
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schizo : Acer 8942G ; KDE 4, BTRFS over LUKS ; W7 (prend la poussière)
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par x4rkz »

Oui je fais bien face à des kernel panic.

Je ne pense pas qu'un de mes composants soit mort, j'ai un ordinateur neuf de 2 mois.

Je viens de lancer smartctl -t long /dev/sda et je dois attendre 169min avant d'avoir la réponse.
Moviuro
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par Moviuro »

x4rkz a écrit :Je ne pense pas qu'un de mes composants soit mort, j'ai un ordinateur neuf de 2 mois.
Les pannes peuvent vraiment arriver n'importe quand ;)
Aussi, si tu y arrives, lance-nous les logs de ta machine journalctl -b -1 (retourne le log du boot précédant, donc à lancer juste après être revenu d'un kernel panic)

Pour mettre les logs en ligne (publiquement accessibles), utilise la commande suivante :

Code : Tout sélectionner

journalctl -b -1 | curl -F 'f:1=<-' ix.io
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par x4rkz »

D'accord merci, je ferai ça après le long test du disque :p

Oui je sais que les pannes peuvent arriver n'importe quand, mais je pense (et j'espère) qu'il y a une raison plus probable que l"e disque est mort" :p surtout que pour l'instant c'est surtout arrivé lorsque j'utilise pip install,

Mettons que le disque soit "mort", ça veut dire quoi exactement ? que certains octets du disque ne marchent plus ? Et qu'à chaque fois que je lance pip instal, l'installation se fait sur ces octets ?
Y a-t-il une solution ? Par exemple force l'écriture/lecture dans une zone qui marche bien ?
Et tu penses que le mauvais fonctionnement serait arrivé comme ça sans raison apparente ?
Moviuro
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par Moviuro »

x4rkz a écrit :que certains octets du disque ne marchent plus ? Et qu'à chaque fois que je lance pip instal, l'installation se fait sur ces octets ?
Y a-t-il une solution ? Par exemple force l'écriture/lecture dans une zone qui marche bien ?
Et tu penses que le mauvais fonctionnement serait arrivé comme ça sans raison apparente ?
Oui pour les secteurs du disque qui sont morts. Ils deviennent inutilisables. Normalement, le système de fichier doit s'en rendre compte par lui-même et "éviter" les secteurs cassés. S'il y a KP (kernle panic), c'est que le FS (système de fichiers) ne fait plus son job et donc que ton disque est vraiment mort.
Je ne pense pas qu'il soit possible de forcer l'utilisation des secteurs fonctionnels. Ce sera plus simple de faire changer le disque (qui doit être sous garantie, de même que ton PC).
Les défauts ont des causes variées : chocs, vibration, température, radiations et flux de vilains protons, fantômes, etc. Il n'y a que toi pour nous assurer que "nope, mon PC est dans une caisse anti-choc climatisée en plomb et exorcisé" :mrgreen:
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par x4rkz »

J'ai un petit problème avec pasrtebinit : Bad API request, invalid api_dev_key

Donc je copie colle ici à la main ci dessous, mais j'ai surtout retenu cette ligne # 1 Extended offline Completed without error 00% 650 -, donc je suppose que mon HDD marche bien ? :p

Code : Tout sélectionner

x4rkz@localhost:~$ sudo smartctl -a /dev/sda
[sudo] password for x4rkz: 
smartctl 6.4 2015-06-04 r4109 [x86_64-linux-4.2.5-1-ARCH] (local build)
Copyright (C) 2002-15, Bruce Allen, Christian Franke, www.smartmontools.org

=== START OF INFORMATION SECTION ===
Model Family:     HGST Travelstar 7K1000
Device Model:     HGST HTS721010A9E630
Serial Number:    JR100X6P2GDAVE
LU WWN Device Id: 5 000cca 7dce2ba90
Firmware Version: JB0OA3J0
User Capacity:    1,000,204,886,016 bytes [1.00 TB]
Sector Sizes:     512 bytes logical, 4096 bytes physical
Rotation Rate:    7200 rpm
Form Factor:      2.5 inches
Device is:        In smartctl database [for details use: -P show]
ATA Version is:   ATA8-ACS T13/1699-D revision 6
SATA Version is:  SATA 3.0, 6.0 Gb/s (current: 6.0 Gb/s)
Local Time is:    Tue Dec 29 14:22:26 2015 UTC
SMART support is: Available - device has SMART capability.
SMART support is: Enabled

=== START OF READ SMART DATA SECTION ===
SMART overall-health self-assessment test result: PASSED

General SMART Values:
Offline data collection status:  (0x00) Offline data collection activity
                                        was never started.
                                        Auto Offline Data Collection: Disabled.
Self-test execution status:      (   0) The previous self-test routine completed
                                        without error or no self-test has ever 
                                        been run.
Total time to complete Offline 
data collection:                (   45) seconds.
Offline data collection
capabilities:                    (0x5b) SMART execute Offline immediate.
                                        Auto Offline data collection on/off support.
                                        Suspend Offline collection upon new
                                        command.
                                        Offline surface scan supported.
                                        Self-test supported.
                                        No Conveyance Self-test supported.
                                        Selective Self-test supported.
SMART capabilities:            (0x0003) Saves SMART data before entering
                                        power-saving mode.
                                        Supports SMART auto save timer.
Error logging capability:        (0x01) Error logging supported.
                                        General Purpose Logging supported.
Short self-test routine 
recommended polling time:        (   2) minutes.
Extended self-test routine
recommended polling time:        ( 169) minutes.
SCT capabilities:              (0x003d) SCT Status supported.
                                        SCT Error Recovery Control supported.
                                        SCT Feature Control supported.
                                        SCT Data Table supported.

SMART Attributes Data Structure revision number: 16
Vendor Specific SMART Attributes with Thresholds:
ID# ATTRIBUTE_NAME          FLAG     VALUE WORST THRESH TYPE      UPDATED  WHEN_FAILED RAW_VALUE
  1 Raw_Read_Error_Rate     0x000b   100   100   062    Pre-fail  Always       -       0
  2 Throughput_Performance  0x0005   100   100   040    Pre-fail  Offline      -       0
  3 Spin_Up_Time            0x0007   141   141   033    Pre-fail  Always       -       2
  4 Start_Stop_Count        0x0012   100   100   000    Old_age   Always       -       477
  5 Reallocated_Sector_Ct   0x0033   100   100   005    Pre-fail  Always       -       0
  7 Seek_Error_Rate         0x000b   100   100   067    Pre-fail  Always       -       0
  8 Seek_Time_Performance   0x0005   100   100   040    Pre-fail  Offline      -       0
  9 Power_On_Hours          0x0012   099   099   000    Old_age   Always       -       651
 10 Spin_Retry_Count        0x0013   100   100   060    Pre-fail  Always       -       0
 12 Power_Cycle_Count       0x0032   100   100   000    Old_age   Always       -       477
191 G-Sense_Error_Rate      0x000a   100   100   000    Old_age   Always       -       0
192 Power-Off_Retract_Count 0x0032   100   100   000    Old_age   Always       -       9
193 Load_Cycle_Count        0x0012   100   100   000    Old_age   Always       -       8174
194 Temperature_Celsius     0x0002   146   146   000    Old_age   Always       -       41 (Min/Max 16/56)
196 Reallocated_Event_Count 0x0032   100   100   000    Old_age   Always       -       0
197 Current_Pending_Sector  0x0022   100   100   000    Old_age   Always       -       0
198 Offline_Uncorrectable   0x0008   100   100   000    Old_age   Offline      -       0
199 UDMA_CRC_Error_Count    0x000a   200   200   000    Old_age   Always       -       0
223 Load_Retry_Count        0x000a   100   100   000    Old_age   Always       -       0

SMART Error Log Version: 1
No Errors Logged

SMART Self-test log structure revision number 1
Num  Test_Description    Status                  Remaining  LifeTime(hours)  LBA_of_first_error
# 1  Extended offline    Completed without error       00%       650         -
# 2  Extended offline    Aborted by host               90%       648         -
# 3  Extended offline    Aborted by host               90%       648         -

SMART Selective self-test log data structure revision number 1
 SPAN  MIN_LBA  MAX_LBA  CURRENT_TEST_STATUS
    1        0        0  Not_testing
    2        0        0  Not_testing
    3        0        0  Not_testing
    4        0        0  Not_testing
    5        0        0  Not_testing
Selective self-test flags (0x0):
  After scanning selected spans, do NOT read-scan remainder of disk.
If Selective self-test is pending on power-up, resume after 0 minute delay.
Moviuro
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par Moviuro »

Okay, on dirait que ton disque est ok (Reallocated_... est à 0).

Je ne peux plus t'aider là par contre, mais mets à jour ta machine si ce n'est pas le cas...
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x4rkz
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par x4rkz »

Je viens de lancer pip mais cette fois ci pip2, et j'ai encore eu le kernel panic, je te donne le résultat de la commande que tu m'as donné :

http://ix.io/n2E

Et je fais régulièrement un pacman -Syu ou -Syyu donc ma machine est à jour

EDIT: J'ai réussie à installer numpy matplotlib et pybluez en faisant symplement pacman -S python-laLibEnQuestion
Cependant j'aimerais quand même m'assurer que le kernel panic ne se produise pas en dehors de l'utilisation de pip, par exemple je n'arrivais pas à installer texlive-most, j'ai du installer d'abord texlive-core puis tous les autres paquets un par un.
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benjarobin
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par benjarobin »

Tu as déjà un souci, tu n'as pas configuré le hostname.
Sinon aucune erreur apparemment dans le log, il faudrait vraiment décrit ce qui se passe quand cela plante
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par x4rkz »

Oui pour le hostname je comptais m'en occuper bientôt, mais quels problèmmes peut engendrer la non configuration de l'hostame ?

J'ai provoqué l'erreur dans un tty : http://hpics.li/23c26dc

Par contre eu un kernel panic en testant un de mes programmes bash qui ne fait que afficher des nombres..
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par benjarobin »

https://bbs.archlinux.org/viewtopic.php?id=203010
Soit il y a un sérieux bug dans le kernel soit tu as un problème matériel.
Le plus simple est de tester avec un autre kernel plus vieux
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par x4rkz »

J'ai trouvé un moyen plus élémentaire de provoquer mon crash, j'étais en train de coder un générateur d'entrée pour un algorithme, donc rien que des affichages de nombres en gros, et si je le lance une dizaine de fois d'affilé ça plante.

Du coup ce problème en devient un très génant, et pas seulement celui qui apparait lorsque j'utilise pip. Voici le code de mon programme : http://ix.io/n42 pour montrer que je ne fais rien de "particulier"

Je vais essayer de regarder du côté de l'erreur parlant de mon CPU, ainsi que du côté des kernels
Moviuro
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par Moviuro »

x4rkz a écrit :J'ai trouvé un moyen plus élémentaire de provoquer mon crash, j'étais en train de coder un générateur d'entrée pour un algorithme, donc rien que des affichages de nombres en gros, et si je le lance une dizaine de fois d'affilé ça plante.

Du coup ce problème en devient un très génant, et pas seulement celui qui apparait lorsque j'utilise pip. Voici le code de mon programme : http://ix.io/n42 pour montrer que je ne fais rien de "particulier"

Je vais essayer de regarder du côté de l'erreur parlant de mon CPU, ainsi que du côté des kernels
Reviens à un kernel plus vieux comme suggéré par @benjarobin https://wiki.archlinux.org/index.php/Do ... g_packages
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par x4rkz »

Oui c'est ce que je vais faire, comment est-ce que je choisis quelle version prendre ? Dois-je juste prendre la précédente ?
x4rkz
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par x4rkz »

Alors déjà je n'avais pas linux-headers, donc je l'ai installé mais le problème était toujours là.

Ensuite j'ai téléchargé linux et linux-headers version 4.2.1 (j'ai 4.5.1) et j'ai fais pacman -U linux... linux-headers...

Lors du reboot j'ai un problème "/boot not mounted" et je dois entrer le mdp root ou taper CTRL+D, du coup j'ai réinstallé les derniers kernels et le redémarrage se refait bien.

Ai-je mal fait quelque chose pour que j'ai cette erreur /boot FAILED to mount ? Ou est-ce parce que je dois configurer d'autres choses après avoir installer un kernel moins récent ?

EDIT: j'ai refait la manip, cette fois-ci aucun problème, j'ai installé l'ancien kernel mais j'arrive toujours à reproduire le bug en spammant l'exécution dde mon script

EDIT: 2 J'ai essaye avec le noyau 3.17 mais c'est encore pire, l'erreur arrive plus souvent et même quelques fois au démarrage, De plus j'ai besoin du paquet nvidia, sans quoi j'ai des nouveau E[ error qui me font planter le système assez souvent et ce paquet nécessite linux >= 4.2
x4rkz
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Re: [FREEZE/CRASH] Installation lib python

Message par x4rkz »

Alors j'ai vu dans le lien de benjarobin qu'ils parlaient de SpeedStep, je l'ai désactivé dans le BIOS. D'après ce que j'ai compris c'est une genre d'overclocking, un truc qui a une influence sur la fréquence du CPU.

J'ai rééssayé de provoquer le bug, j'ai lancer une cinquantaine de fois mon script et aucun problème, ensuite j'ai fais le fameux pip install numpy, et il bloque au même endroit (installing setup.py numpy) mais je peux faire CTRL+C, en gros pip nne marche toujours pas mais il ne fait plus planter le système, peut être qu'il marche mais qu'il est juste super lent.

Donc mon hypothèse est la suivante, :le speedstep était une option qui s'activait pou accélérer le CPU mais lorsqu'elle s'activait faisait planter le système pour une raison "d'incompatibilité" ou mauvaise gestion du kernel ou je ne sais quoi. j'ai d'ailleurs remarqué que j'arrivais à enchainer moins vite l'execution de mon script en spammant fleche du haut, entrer.

J'aimerais bien avoir quelques informations sur le speedstep si vous en avez.

J'espère que je n'aurai plus de problèmes de ce genre, en tout cas aussi récurrent, je pense que mon système n'a plus de "pic de performance" mais est plus stable maintenant.
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