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On dérive un peu (beaucoup ?), certes ton processeur est assez vieux, mais comme même... Tu as bien -j3 dans ton makepkg.conf ? Personnellement j'ai -j10 sur mon core i7. Donc si on considère que les cœurs sont équivalent et que tu a -j1 alors : 15 * 10 = 150 min = 2h30...
Finalement je n'ai rien dis si tu as oublié de mettre -j3 et que tu as toujours -j1...

bien vu @benjarobin d'ailleurs j'ouvre un autre poste.

Il faut aussi penser à mettre à jour gcc-gcj-ecj...
Sans ça ça bloque pour la réinstallation de pdftk....

Avec comme message d'erreur : La dernière version de gcc-gcj-ecj intègre visiblement ce script ecj1.