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Grosso modo, systemctl enable/disable équivaut à mettre un DAEMON dans le rc.conf sous initscripts (et donc à lancer un service au démarrage ou non ; sachant que certains services sont déjà présents car nécessaire à systemd, comme dbus).
systemctl stop/restart/etc. permet de gérer le service lors de ta session courante (équivalent à rc.d stop/start/etc. avec initscripts).