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Je viens de faie les maj de grub et du répertoire unifié /usr/bin et je constate qu'au démarrage je reste bloqué une dizaine de secondes supplémentaires devant un écran noir avant que ma session graphique ne s'affiche (le boot est normal).

De plus lorsque je lance la commande su dans un terminal cela prend plus de 20 secondes après la saisie du code pour passer en root.

J'ai le sentiment que ma distro a pris un peu de plomb après cette MàJ

Cela m'étonnerait que ce soit lié. Ce n'est pas le fait de changer d'endroit un exécutable, qui va ajouter 20 secondes pour passer root...
Je suis sceptique.

Une trace du défunt ConsoleKit à effacer: