[grub] réparation du grub nécessaire à chaque mise à jour

[jackinthebox]

Bonjour, depuis quelque temps, je suis obligé à chaque mise à jour de passer par une clef usb pour réinstaller grub. Au démarrage, le système présente de défauts de montage. Je suis également obligé, lors de la réparation de grub, de réinstaller linux filesystem sans quoi mkinitcpio -p linux me renvoie une erreur.
Merci d'avance.

[benjarobin]

Bonjour,
Il va nous falloir beaucoup plus d'information, et surtout avec les messages d'erreurs exactes pour tout ce que tu rencontres. Peux-tu donner aussi exactement les commandes que tu réalises.
Par exemple, que sous-entends-tu par "réinstaller linux filesystem" ?
Peux-tu donner aussi la sortie de :

Code : Tout sélectionner

cat /etc/fstab
sudo blkid
sudo fdisk -l

Et peux-tu nous décrire les partitions et comment elles sont montées ?

[jackinthebox]

Merci! D'abord le retour des commandes demandées :

Code : Tout sélectionner

cat /etc/fstab
# 
# /etc/fstab: static file system information
#
# <file system> <dir>   <type>  <options>       <dump>  <pass>
# /dev/sda2
UUID=fa1c05a0-86d4-430d-b768-5c7d0a0688e2       /               ext4            rw,relatime,data=ordered        0 1

# /dev/sda1
UUID=CB99-9562          /boot           vfat            rw,relatime,fmask=0022,dmask=0022,codepage=437,iocharset=iso8859-1,shortname=mixed,errors=remount-ro    0 2

# /dev/sda3
# UUID=24d7ddcf-b89c-4d48-b7db-7e0433242616     none            swap            defaults        0 0

#documents
UUID=7e9443ad-d2f0-4547-af70-63b8bf79e3af  /mnt/Documents ext4 defaults    0   0

#Trucs en vrac
UUID=5ec2e189-b156-4dd8-bfea-1fcb6a3adb29   /mnt/Trucs\040en\040vrac    ext4    defaults    0   0

#Media
UUID=072d3c08-bfd0-401e-9274-8d3efe666db8   /mnt/Media  ext4    defaults    0   0

#mariadb
/home/mrx/Media/.mysql /var/lib/mysql    bind   ,x-systemd.requires=/mnt/Media,defaults,bind  0       0

Code : Tout sélectionner

sudo blkid 
/dev/loop1: BLOCK_SIZE="131072" TYPE="squashfs"
/dev/sdb2: UUID="5ec2e189-b156-4dd8-bfea-1fcb6a3adb29" BLOCK_SIZE="4096" TYPE="ext4" PARTUUID="cbe9671f-02"
/dev/sdb3: UUID="072d3c08-bfd0-401e-9274-8d3efe666db8" BLOCK_SIZE="4096" TYPE="ext4" PARTUUID="cbe9671f-03"
/dev/sdb1: UUID="7e9443ad-d2f0-4547-af70-63b8bf79e3af" BLOCK_SIZE="4096" TYPE="ext4" PARTUUID="cbe9671f-01"
/dev/loop4: BLOCK_SIZE="131072" TYPE="squashfs"
/dev/loop2: BLOCK_SIZE="131072" TYPE="squashfs"
/dev/loop0: BLOCK_SIZE="131072" TYPE="squashfs"
/dev/sdc2: SEC_TYPE="msdos" LABEL_FATBOOT="MISO_EFI" LABEL="MISO_EFI" UUID="07BE-0A1D" BLOCK_SIZE="512" TYPE="vfat"
/dev/sdc1: BLOCK_SIZE="2048" UUID="2024-07-30-08-28-21-00" LABEL="MANJARO_XFCE_2405" TYPE="iso9660"
/dev/sda2: UUID="fa1c05a0-86d4-430d-b768-5c7d0a0688e2" BLOCK_SIZE="4096" TYPE="ext4" PARTUUID="a0051cfa-d486-0d43-b768-5c7d0a0688e2"
/dev/sda1: UUID="CB99-9562" BLOCK_SIZE="512" TYPE="vfat" PARTLABEL="EFI System Partition" PARTUUID="f6fc2850-4e60-1246-919a-3040937257a5"
/dev/loop5: BLOCK_SIZE="131072" TYPE="squashfs"
/dev/loop3: BLOCK_SIZE="131072" TYPE="squashfs"

Code : Tout sélectionner

sudo fdisk -l
Disque /dev/sda : 465,76 GiB, 500107862016 octets, 976773168 secteurs
Modèle de disque : CT500MX500SSD1  
Unités : secteur de 1 × 512 = 512 octets
Taille de secteur (logique / physique) : 512 octets / 4096 octets
taille d'E/S (minimale / optimale) : 4096 octets / 4096 octets
Type d'étiquette de disque : gpt
Identifiant de disque : E062D943-3EC1-4C17-8F41-B86FAF580937

Périphérique   Début       Fin  Secteurs Taille Type
/dev/sda1       2048   1050623   1048576   512M Système EFI
/dev/sda2    1050624 976773119 975722496 465,3G Système de fichiers Linux


Disque /dev/sdb : 931,51 GiB, 1000204886016 octets, 1953525168 secteurs
Modèle de disque : ST1000DM010-2EP1
Unités : secteur de 1 × 512 = 512 octets
Taille de secteur (logique / physique) : 512 octets / 4096 octets
taille d'E/S (minimale / optimale) : 4096 octets / 4096 octets
Type d'étiquette de disque : dos
Identifiant de disque : 0xcbe9671f

Périphérique Amorçage      Début        Fin  Secteurs Taille Id Type
/dev/sdb1                   2048  512002047 512000000 244,1G 83 Linux
/dev/sdb2              512002048 1024002047 512000000 244,1G 83 Linux
/dev/sdb3             1024002048 1953523711 929521664 443,2G 83 Linux


Disque /dev/loop0 : 55,66 MiB, 58363904 octets, 113992 secteurs
Unités : secteur de 1 × 512 = 512 octets
Taille de secteur (logique / physique) : 512 octets / 512 octets
taille d'E/S (minimale / optimale) : 512 octets / 512 octets


Disque /dev/loop1 : 91,69 MiB, 96141312 octets, 187776 secteurs
Unités : secteur de 1 × 512 = 512 octets
Taille de secteur (logique / physique) : 512 octets / 512 octets
taille d'E/S (minimale / optimale) : 512 octets / 512 octets


Disque /dev/loop2 : 4 KiB, 4096 octets, 8 secteurs
Unités : secteur de 1 × 512 = 512 octets
Taille de secteur (logique / physique) : 512 octets / 512 octets
taille d'E/S (minimale / optimale) : 512 octets / 512 octets


Disque /dev/loop3 : 38,83 MiB, 40714240 octets, 79520 secteurs
Unités : secteur de 1 × 512 = 512 octets
Taille de secteur (logique / physique) : 512 octets / 512 octets
taille d'E/S (minimale / optimale) : 512 octets / 512 octets


Disque /dev/loop4 : 164,82 MiB, 172830720 octets, 337560 secteurs
Unités : secteur de 1 × 512 = 512 octets
Taille de secteur (logique / physique) : 512 octets / 512 octets
taille d'E/S (minimale / optimale) : 512 octets / 512 octets


Disque /dev/loop5 : 55,66 MiB, 58363904 octets, 113992 secteurs
Unités : secteur de 1 × 512 = 512 octets
Taille de secteur (logique / physique) : 512 octets / 512 octets
taille d'E/S (minimale / optimale) : 512 octets / 512 octets


Disque /dev/sdc : 14,91 GiB, 16013852672 octets, 31277056 secteurs
Modèle de disque : USB Flash Drive 
Unités : secteur de 1 × 512 = 512 octets
Taille de secteur (logique / physique) : 512 octets / 512 octets
taille d'E/S (minimale / optimale) : 512 octets / 512 octets
Type d'étiquette de disque : dos
Identifiant de disque : 0x00000000

Périphérique Amorçage   Début     Fin Secteurs Taille Id Type
/dev/sdc1    *             64 6921339  6921276   3,3G  0 Vide
/dev/sdc2             6921340 6929531     8192     4M ef EFI (FAT-12/16/32)

Sda est un ssd contenant sda1 ,la partition boot et sda2, la partition linux.
sdb est un disque dur de stockage découpé en trois partitions et monté dans différents répertoire de /home/mrx.
sdc est un cléf usb.

Après la mise à jour du système, le pc ne boote pas et me renvoie des messages d'erreurs concernant le montage de certaines partitions de sdb que je n'ai malheureusement pas eu la présence d'esprit de clairement noter...
Lors de la réparation du grub depuis une clef usb, la commande

Code : Tout sélectionner

mkiniticpio -p linux

me renvoie une erreur du type

Code : Tout sélectionner

lib/modules/x.x.-x-ARCH is not a valid kernel  module directory

que je parviens à circonvenir en faisant

Code : Tout sélectionner

sudo pacman -S filesytem linux 

.

[benjarobin]

Pourquoi tu indiques "lors de la réparation du grub" ? Qu'est-ce que tu fais en lien avec Grub ? Ce dernier ne devrait pas être "réparé", il y a rarement besoin de réparer Grub, sauf si, par exemple, tu as un Windows qui le détruit complètement (ce qui est assez rare au final).

Tu ne donnes malheureusement pas toutes les informations : Ce que tu fais depuis ton live USB, les commandes sont depuis un chroot (comment entres-tu dans ce chroot), ... ?
Est-ce que tu montes bien la partition de boot/ESP depuis le live USB quand tu essayes de réparer (je pense que non) ?

Je pense savoir où est le problème, mais, sans les informations, il est difficile d'aider (c'est classiquement un problème de partition de boot, erreur réalisée durant l'installation).

Je suppose que tu as Grub d'installé comme tu le cites ? Comment celui-ci est installé (ligne de commande utilisée) ? Est-ce un boot UEFI (je suppose) ou un boot legacy/MBR ?
Quel est le contenu du grub.cfg ? Vérifie qu'il y a bien un seul grub.cfg (voir question ci-dessous).

Quel est le contenu de la partition de boot/ESP ? Quel est le contenu du dossier /boot si la partition de boot/ESP n'est pas montée ?

Depuis un chroot, quelle est la version du kernel linux installé (pacman -Q linux), et quel est le contenu de : ls -l /usr/lib/modules

[jackinthebox]

La version de linux est la suivante : linux 6.11.6.arch1-1 .
ls -l /usr/lib/modules me retourne

Code : Tout sélectionner

total 28
drwxr-xr-x 3 root root 4096 30 déc.   2022 6.0.12-arch1-1
drwxr-xr-x 3 root root 4096  6 janv.  2023 6.1.1-arch1-1
drwxr-xr-x 3 root root 4096 12 janv.  2023 6.1.3-arch1-1
drwxr-xr-x 3 root root 4096 18 janv.  2023 6.1.4-arch1-1
drwxr-xr-x 3 root root 4096 22 janv.  2023 6.1.6-arch1-3
drwxr-xr-x 6 root root 4096  4 nov.  08:26 6.11.6-arch1-1
drwxr-xr-x 3 root root 4096  4 nov.  08:11 6.6.59-1-lts

.

LE boot est bien un boot EFI.
la partition de boot contient les fichiers suivants:

Code : Tout sélectionner

EFI  grub  initramfs-linux-fallback.img  initramfs-li

.
Voilà ce que contient grub.cfg :

Code : Tout sélectionner

#
# DO NOT EDIT THIS FILE
#
# It is automatically generated by grub-mkconfig using templates
# from /etc/grub.d and settings from /etc/default/grub
#

### BEGIN /etc/grub.d/00_header ###
insmod part_gpt
insmod part_msdos
if [ -s $prefix/grubenv ]; then
  load_env
fi
if [ "${next_entry}" ] ; then
   set default="${next_entry}"
   set next_entry=
   save_env next_entry
   set boot_once=true
else
   set default="0"
fi

if [ x"${feature_menuentry_id}" = xy ]; then
  menuentry_id_option="--id"
else
  menuentry_id_option=""
fi

export menuentry_id_option

if [ "${prev_saved_entry}" ]; then
  set saved_entry="${prev_saved_entry}"
  save_env saved_entry
  set prev_saved_entry=
  save_env prev_saved_entry
  set boot_once=true
fi

function savedefault {
  if [ -z "${boot_once}" ]; then
    saved_entry="${chosen}"
    save_env saved_entry
  fi
}

function load_video {
  if [ x$feature_all_video_module = xy ]; then
    insmod all_video
  else
    insmod efi_gop
    insmod efi_uga
    insmod ieee1275_fb
    insmod vbe
    insmod vga
    insmod video_bochs
    insmod video_cirrus
  fi
}

if [ x$feature_default_font_path = xy ] ; then
   font=unicode
else
insmod part_gpt
insmod ext2
set root='hd0,gpt2'
if [ x$feature_platform_search_hint = xy ]; then
  search --no-floppy --fs-uuid --set=root --hint-bios=hd0,gpt2 --hint-efi=hd0,gpt2 --hint-baremetal=ahci0,gpt2  fa1c05a0-86d4-430d-b768-5c7d0a0688e2
else
  search --no-floppy --fs-uuid --set=root fa1c05a0-86d4-430d-b768-5c7d0a0688e2
fi
    font="/usr/share/grub/unicode.pf2"
fi

if loadfont $font ; then
  set gfxmode=auto
  load_video
  insmod gfxterm
  set locale_dir=$prefix/locale
  set lang=fr_FR
  insmod gettext
fi
terminal_input console
terminal_output gfxterm
if [ x$feature_timeout_style = xy ] ; then
  set timeout_style=menu
  set timeout=5
# Fallback normal timeout code in case the timeout_style feature is
# unavailable.
else
  set timeout=5
fi
### END /etc/grub.d/00_header ###

### BEGIN /etc/grub.d/10_linux ###
menuentry 'Arch Linux' --class arch --class gnu-linux --class gnu --class os $menuentry_id_option 'gnulinux-simple-fa1c05a0-86d4-430d-b768-5c7d0a0688e2' {
	load_video
	set gfxpayload=keep
	insmod gzio
	insmod part_gpt
	insmod fat
	set root='hd0,gpt1'
	if [ x$feature_platform_search_hint = xy ]; then
	  search --no-floppy --fs-uuid --set=root --hint-bios=hd0,gpt1 --hint-efi=hd0,gpt1 --hint-baremetal=ahci0,gpt1  CB99-9562
	else
	  search --no-floppy --fs-uuid --set=root CB99-9562
	fi
	echo	'Chargement de Linux linux…'
	linux	/vmlinuz-linux root=UUID=fa1c05a0-86d4-430d-b768-5c7d0a0688e2 rw  loglevel=3 nvidia_drm.modeset=1 quiet
	echo	'Chargement du disque mémoire initial…'
	initrd	/intel-ucode.img /initramfs-linux.img
}
submenu 'Options avancées pour Arch Linux' $menuentry_id_option 'gnulinux-advanced-fa1c05a0-86d4-430d-b768-5c7d0a0688e2' {
	menuentry 'Arch Linux, avec Linux linux' --class arch --class gnu-linux --class gnu --class os $menuentry_id_option 'gnulinux-linux-advanced-fa1c05a0-86d4-430d-b768-5c7d0a0688e2' {
		load_video
		set gfxpayload=keep
		insmod gzio
		insmod part_gpt
		insmod fat
		set root='hd0,gpt1'
		if [ x$feature_platform_search_hint = xy ]; then
		  search --no-floppy --fs-uuid --set=root --hint-bios=hd0,gpt1 --hint-efi=hd0,gpt1 --hint-baremetal=ahci0,gpt1  CB99-9562
		else
		  search --no-floppy --fs-uuid --set=root CB99-9562
		fi
		echo	'Chargement de Linux linux…'
		linux	/vmlinuz-linux root=UUID=fa1c05a0-86d4-430d-b768-5c7d0a0688e2 rw  loglevel=3 nvidia_drm.modeset=1 quiet
		echo	'Chargement du disque mémoire initial…'
		initrd	/intel-ucode.img /initramfs-linux.img
	}
	menuentry 'Arch Linux, with Linux linux (fallback initramfs)' --class arch --class gnu-linux --class gnu --class os $menuentry_id_option 'gnulinux-linux-fallback-fa1c05a0-86d4-430d-b768-5c7d0a0688e2' {
		load_video
		set gfxpayload=keep
		insmod gzio
		insmod part_gpt
		insmod fat
		set root='hd0,gpt1'
		if [ x$feature_platform_search_hint = xy ]; then
		  search --no-floppy --fs-uuid --set=root --hint-bios=hd0,gpt1 --hint-efi=hd0,gpt1 --hint-baremetal=ahci0,gpt1  CB99-9562
		else
		  search --no-floppy --fs-uuid --set=root CB99-9562
		fi
		echo	'Chargement de Linux linux…'
		linux	/vmlinuz-linux root=UUID=fa1c05a0-86d4-430d-b768-5c7d0a0688e2 rw  loglevel=3 nvidia_drm.modeset=1 quiet
		echo	'Chargement du disque mémoire initial…'
		initrd	/intel-ucode.img /initramfs-linux-fallback.img
	}
}

### END /etc/grub.d/10_linux ###

### BEGIN /etc/grub.d/15_ostree ###
### END /etc/grub.d/15_ostree ###

### BEGIN /etc/grub.d/20_linux_xen ###
### END /etc/grub.d/20_linux_xen ###

### BEGIN /etc/grub.d/25_bli ###
if [ "$grub_platform" = "efi" ]; then
  insmod bli
fi
### END /etc/grub.d/25_bli ###

### BEGIN /etc/grub.d/30_os-prober ###
### END /etc/grub.d/30_os-prober ###

### BEGIN /etc/grub.d/30_uefi-firmware ###
if [ "$grub_platform" = "efi" ]; then
	fwsetup --is-supported
	if [ "$?" = 0 ]; then
		menuentry 'UEFI Firmware Settings' $menuentry_id_option 'uefi-firmware' {
			fwsetup
		}
	fi
fi
### END /etc/grub.d/30_uefi-firmware ###

### BEGIN /etc/grub.d/35_fwupd ###
### END /etc/grub.d/35_fwupd ###

### BEGIN /etc/grub.d/40_custom ###
# This file provides an easy way to add custom menu entries.  Simply type the
# menu entries you want to add after this comment.  Be careful not to change
# the 'exec tail' line above.
### END /etc/grub.d/40_custom ###

### BEGIN /etc/grub.d/41_custom ###
if [ -f  ${config_directory}/custom.cfg ]; then
  source ${config_directory}/custom.cfg
elif [ -z "${config_directory}" -a -f  $prefix/custom.cfg ]; then
  source $prefix/custom.cfg
fi
### END /etc/grub.d/41_custom ###

Voilà ce que je fait depuis ma clef usb quand une mise a jour du noyau plante le démarrage :

Code : Tout sélectionner

mount /dev/sda2  /mnt
mount /dev/sda1 /mnt/boot/efi
manjaro-chroot /mnt
mkinitcpio --p linux
 

Je récupère alors l'erreur lib/modules/6.11.6-1-ARCH is not a valid kernel module directory .
Je poursuis avec

Code : Tout sélectionner

pacman -S filesystem linux
grub-mkconfig -o /boot/grub/grub.cfg
grub-install --target=x86_64-efi --efi-directory=/boot/efi --bootloader-id=Archlinux

Je quitte, je redémarre, et tout fonctionne.

[benjarobin]

Ton fstab indique que la partition ESP est monté dans /boot, et lorsque tu répares tu la montes dans /boot/efi...
Le fichier grub.cfg que tu donnes ne peux pas fonctionner avec un montage de la partition de boot en tant que /boot/efi...
Hum, c'est un peu le désordre... Je ne suis pas sûr de comprendre comment cela tombe en marche...

Tu n'as pas répondu à ces questions :
- Quel est le contenu de la partition de boot/ESP ? => Tu m'as donné une partie de la sortie. Peux tu donner le contenu complet, par exemple via la commande : find /boot
- Quel est le contenu du dossier /boot si la partition de boot/ESP n'est pas montée ? => Non répondu.

---
Bon, le plus simple est de tout nettoyer (méthode bourrin) et de tout réinstaller.
Alors tu dois faire ceci depuis le live USB (je fais l’hypothèse qu'il n'y a pas d'autres OS d'installé) :

Code : Tout sélectionner

efibootmgr

La commande efibootmgr dois te lister les bootloader enregistrés dans la NVRAM de ta carte mère.
Tu dois supprimer toutes les entrées en lien avec Grub/Arch Linux. Donc pour chaque entrée BootXXXX que tu veux supprimer :

Code : Tout sélectionner

efibootmgr -b XXXX -B

Puis nettoyage et montage des partitions en dehors du chroot

Code : Tout sélectionner

mount /dev/sda2  /mnt
rm -rf /mnt/boot/*
mkdir /mnt/boot/efi
mount /dev/sda1 /mnt/boot/efi
rm -rf /mnt/boot/efi/*

rm -rf /mnt/usr/lib/modules/*arch1*

Tu dois corriger le fstab pour monter la partition ESP dans /boot/efi, et non /boot.
Tu peux éditer le fichier à la main, ou utiliser cette commande :

Code : Tout sélectionner

sed -i "s|/boot|/boot/efi|" /mnt/etc/fstab

Entrée dans le chroot, et réparation...

Code : Tout sélectionner

manjaro-chroot /mnt
pacman -S linux grub

# En fonction de ton CPU
pacman -S amd-ucode
pacman -S intel-ucode

grub-install --target=x86_64-efi --efi-directory=/boot/efi --bootloader-id=Archlinux
grub-mkconfig -o /boot/grub/grub.cfg

Tu peux quitter le chroot, et reboot.

[jackinthebox]

Bonsoir,
Merci pour ton aide. J'ai procédé comme tu me l'as indiqué, le boot s'interrompt après avoir indiqué que sda2 était clean et renvoyé l'erreur
failed to start mariadb 11.5.2 database server . Puis bien plus tard failed to start wait for network to be configured et failed to start postgresql database server J'ai constaté que je pouvais basculer sur les tty. J'ai essayé de démarrer avec les options fallback initramfs avec le même résultat.

[benjarobin]

Hum, il y a de fortes chances que ces erreurs étaient déjà avant, au vu de l'état de ton système... Ce n'est clairement pas ton problème ici.
Je te rassure, bien que cela n'en a pas l'air, ton PC est presque totalement réparé, bien mieux qu'avant
Par contre, j'ai fait une petite bêtise / oubli, tu dois réinstaller tous les paquets qui fournissent des fichiers modules (dkms et autres).
Tu dois réinstallé tous les paquets des commandes suivantes :

Code : Tout sélectionner

pacman -Ql | grep -F "/lib/modules/" | awk '{print $1}' | sort -u
pacman -Qsq dkms

Il doit à minima te manquer ton driver graphique.

[jackinthebox]

Super, merci, ça fonctionne à présent. Comment ça "au vu de l'état de mon système " ? C'est une installation d 'archlinux qui a plus de dix ans... J'ai du coup suivi les conseils de https://wiki.archlinux.org/title/System ... %C3%A7ais) . Si tu as vu passé certaines choses dans mon système qui t'ont fait te dresser les cheveux sur la tête , n'hésite pas à me le signaler ! Merci encore à toi.

[benjarobin]

Cool, désolé pour l'erreur qui a temporairement cassé ton système...
Concernant les erreurs précédentes, peux tu donner la sortie de :
systemctl --fail --all
Et éventuellement le log complet d'un boot (via un site de type pastebin) :
journalctl -b